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标题: 关于两种有机染料分子共同吸附到TiO2团簇后的激发能的计算结果错误的问题 [打印本页]

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学物理不秃头    时间: 2024-3-8 16:42
标题: 关于两种有机染料分子共同吸附到TiO2团簇后的激发能的计算结果错误的问题
各位老师好,最近我计算了两种有机染料分子共同吸附到TiO2团簇后的吸收光谱,模型如下图所示,使用的软件为Gaussian 16, Revision B.01,计算方法如图二和图三,但是计算出的最大吸收波长却达到了2658.46nm(结果如图四),这也未免太大了,因为之前计算出的当两种有机染料分子堆叠但是不吸附到TiO2上的时候最大吸收波长才622.84nm,为什么吸附完后红移了那么多呢,请问我应该是哪一步出错了呢?TiO2模型和吸收光谱的结果文件已补充到附件中,恳请各位老师帮忙看下哪里出错了,感谢各位老师的解答(该模型的优化是用的PBE0,基组Ti原子用的和图三一样,主族元素用的6-31g(d),溶剂模型都一样)

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zjxitcc    时间: 2024-3-8 16:45
实验上是结构确定的TiO2团簇?
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学物理不秃头    时间: 2024-3-8 16:52
zjxitcc 发表于 2024-3-8 16:45
实验上是结构确定的TiO2团簇?

你好,老师,实验上并没有给二氧化钛团簇,这是我照着一篇文献里的模型自己搭建的,目的是想算一下电子转移量。
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wzkchem5    时间: 2024-3-8 17:10
学物理不秃头 发表于 2024-3-8 09:52
你好,老师,实验上并没有给二氧化钛团簇,这是我照着一篇文献里的模型自己搭建的,目的是想算一下电子转 ...

用来饱和TiO2团簇的氢原子的数目正确吗?哪怕多一个、少一个都不行。
另外,总体系的电荷数正确吗?
这两者都未必是和文献一致的,因为文献的吸附质带的电荷,以及和TiO2形成的配位键数,和你都未必一样
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学物理不秃头    时间: 2024-3-8 17:18
wzkchem5 发表于 2024-3-8 17:10
用来饱和TiO2团簇的氢原子的数目正确吗?哪怕多一个、少一个都不行。
另外,总体系的电荷数正确吗?
这 ...

老师您好,氢原子的话我按文献的做法分别把四周的四个氧原子加上氢饱和了,体系的电荷数请问怎么确定对不对呢,高斯自动判断的是0
作者
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wzkchem5    时间: 2024-3-8 17:57
学物理不秃头 发表于 2024-3-8 10:18
老师您好,氢原子的话我按文献的做法分别把四周的四个氧原子加上氢饱和了,体系的电荷数请问怎么确定对不 ...

首先,高斯不能自动判断电荷,只有GaussView可以;其次,在你完全不给电荷信息时,GaussView永远自动判断电荷为0,自旋多重度只能把奇偶判断对。必须通过数电子的方法自己判断正确的电荷,任何金属有机教材都会教怎么数电子。
其次,虽然四周需要加多少氢饱和或许可以参考文献的做法,但是吸附有机分子的表面上是否需要加氢,是和你有机分子和Ti的配位模式有关的,所以不能在不理解基本原理的情况下,机械性照搬文献的做法。必须通过数电子的方式判断是否需要额外加氢
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学物理不秃头    时间: 2024-3-8 20:28
wzkchem5 发表于 2024-3-8 17:57
首先,高斯不能自动判断电荷,只有GaussView可以;其次,在你完全不给电荷信息时,GaussView永远自动判断 ...

不好意思老师,我还是没太明白您的意思,根据之前的知识,计算电荷要用:总的核电荷数-总的电子数,对于每个原子来说,核电荷数是固定的,那电子数不是和核电荷数相等吗?还是说我要根据实际的配位情况来数,比如说乙酸,我在GaussView中如果去掉-COOH中的氢,实际数电子的话是应该算32还是31呢?感谢您的解答
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wzkchem5    时间: 2024-3-8 21:15
学物理不秃头 发表于 2024-3-8 13:28
不好意思老师,我还是没太明白您的意思,根据之前的知识,计算电荷要用:总的核电荷数-总的电子数,对于 ...

只有对于中性体系,电子数才和核电荷数相等。
你把羧基的氢去掉了,如果你想得到羧酸根,那么电子数就和去掉氢原子之前一样;如果你想得到羧基自由基,那么电子数就比去掉氢原子之前少一个
作者
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学物理不秃头    时间: 2024-3-8 21:59
wzkchem5 发表于 2024-3-8 21:15
只有对于中性体系,电子数才和核电荷数相等。
你把羧基的氢去掉了,如果你想得到羧酸根,那么电子数就和 ...

我明白了老师,感谢您,但是请问为什么氢原子数目的错误会对使结果如此怪异呢,就是因为结构错误造成的吗?
作者
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wzkchem5    时间: 2024-3-8 23:22
学物理不秃头 发表于 2024-3-8 14:59
我明白了老师,感谢您,但是请问为什么氢原子数目的错误会对使结果如此怪异呢,就是因为结构错误造成的吗 ...

比如你多加了一个氢原子,氢原子上的那个电子可以跑到任何地方,比如跑到LUMO上。这样本来你是从HOMO到LUMO的激发,就变成从LUMO到LUMO+1的激发了,而LUMO和LUMO+1的能级差可能远小于HOMO和LUMO的能级差,所以激发能小很多
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学物理不秃头    时间: 2024-3-9 10:04
wzkchem5 发表于 2024-3-8 23:22
比如你多加了一个氢原子,氢原子上的那个电子可以跑到任何地方,比如跑到LUMO上。这样本来你是从HOMO到LU ...

我明白了老师,感谢您。那我的理解就是如果我想让体系总电荷为零,并且羧基是以羧酸根的形式存在,那我加入一个氢原子是不是就相当于加入一个带正电的H,它的电子已经被羧基抢去和Ti配位?
作者
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wzkchem5    时间: 2024-3-9 16:46
学物理不秃头 发表于 2024-3-9 03:04
我明白了老师,感谢您。那我的理解就是如果我想让体系总电荷为零,并且羧基是以羧酸根的形式存在,那我加 ...

如果吸附前的体系的电荷为0,你加了一个羧酸根,又加了一个氢原子,加完以后电荷还是0,那么是的。
加之前和加之后电荷都是0,对于你的结论而言缺一不可
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学物理不秃头    时间: 2024-3-9 20:44
wzkchem5 发表于 2024-3-9 16:46
如果吸附前的体系的电荷为0,你加了一个羧酸根,又加了一个氢原子,加完以后电荷还是0,那么是的。
加之 ...

我明白了老师,感谢您




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