计算化学公社

标题: 求助： Amber + ddtpd 绘制自由能景观图 [打印本页]

作者
Author: crush 时间: 2024-3-8 18:20
标题: 求助： Amber + ddtpd 绘制自由能景观图
各位老师好，我使用Amber模拟了蛋白小分子体系共200ns，然后提取10000帧结构计算了PC1和PC2，然后将PC1、PC2放入sob老师开发的ddtpd 程序中去计算，

我设置格点数据为60*60，result2文件中却只有3600行数据，请问该怎么看每行数据对应到哪一帧结构呢？
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作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-9 06:20
只有散点图里面每个点能够对应帧号。而把散点图用我的程序转化成了概率分布，显然有多少个格点就有多少条数据，跟帧号就没对应关系了

作者
Author: crush 时间: 2024-3-9 09:46

sobereva 发表于 2024-3-9 06:20
只有散点图里面每个点能够对应帧号。而把散点图用我的程序转化成了概率分布，显然有多少个格点就有多少条数 ...

好的，谢谢老师

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