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标题: 求助：Amber如何提取能量最低的一帧结构 [打印本页]

作者
Author: crush 时间: 2024-3-9 16:26
标题: 求助：Amber如何提取能量最低的一帧结构
请问各位老师，使用Amber模拟蛋白+小分子 100ns，模拟结束后如何提取这100ns轨迹中能量最低的那一帧呢？

什么命令可以实现呢？

作者
Author: mizu-bai 时间: 2024-3-10 01:56

复制代码

请

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-10 08:17
输出信息中用grep获得所有能量，可以通过excel之类找能量最低的帧，然后VMD保存轨迹时选择相应的帧号

作者
Author: Huschein 时间: 2024-3-10 18:16

mizu-bai 发表于 2024-3-10 01:56
请

是你

作者
Author: crush 时间: 2024-3-11 10:58

sobereva 发表于 2024-3-10 08:17
输出信息中用grep获得所有能量，可以通过excel之类找能量最低的帧，然后VMD保存轨迹时选择相应的帧号

好的，谢谢老师！

作者
Author: crush 时间: 2024-3-11 10:58

mizu-bai 发表于 2024-3-10 01:56
请

多谢，我试试这个Python包

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