二维结构转变为三维结构
乐平 发表于 2024-3-10 11:29
你这个表达呀…… 太容易产生歧义了……
sobereva 发表于 2024-3-10 12:56
先说明为什么不用流行的openbabel,要不然别人推荐了其它的没准儿又不符合你的要求
charmm36 发表于 2024-3-10 15:22
对,是的,把平面的转变成立体三维的,虚拟筛选所用的化合物必须是3D的
乐平 发表于 2024-3-10 15:34
…… 典型的“听君一席话,如听一席话”
你这说了跟没说一样……
charmm36 发表于 2024-3-10 15:41
这么说吧,小分子在溶液中就是三维立体的,但很多网站提供的小分子文库的格式是平面二维的,如2D 的SDF格 ...
乐平 发表于 2024-3-10 15:49
那就我前面说的,把分子式转换成球棍模型
二维三维这样的指代完全不明确,平面分子就是二维的(例如乙 ...
charmm36 发表于 2024-3-10 15:28
之前看到一些评论说openbabel将2维结构转变为3维结构不是其强项,并且我看到这方面的文献不多(可能是我 ...
sobereva 发表于 2024-3-10 15:56
起码你先试了,如果不满足自己要求再说,别看别人怎么评论。不同类型体系之间也没有可比性。
chemdraw ...
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) | Powered by Discuz! X3.3 |