计算化学公社

标题: 求助AlphaFold结构预测为单体的问题 [打印本页]

作者
Author: charmm36 时间: 2024-3-11 09:25
标题: 求助AlphaFold结构预测为单体的问题

求助一下各位前辈，本人通过SWISS-MODEL模拟A蛋白的三维结构，得到两个模型，模型2是同源二聚体（基于解析的晶体结构建模），GMQE分值仅为0.6，模型1是单体（基于AlphaFold高同源性的结构建模），但GMQE的分值高达0.95，因此想用模型1的结构进行结构分析，但通过生化实验已证实A蛋白为同源二聚体，请教一下，有没有什么办法得到模型1的同源二聚体结构？本研究的关注点之一在A蛋白二聚体界面的相互作用分析。

作者
Author: 喵星大佬 时间: 2024-3-12 02:40
m-ZDOCK

作者
Author: charmm36 时间: 2024-3-12 18:52

喵星大佬发表于 2024-3-12 02:40
m-ZDOCK

好的，谢谢指点！

作者
Author: charmm36 时间: 2024-3-12 18:55
本帖最后由 charmm36 于 2024-3-12 19:01 编辑

喵星大佬发表于 2024-3-12 02:40
m-ZDOCK

Availability: M-ZDOCK is freely available to academic users at http://zlab.bu.edu/m-zdock/ 这个打不开，咋办呢？能否分享一下安装程序？不胜感激！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)