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标题: 关于NPT过程中密度变化缓慢与实验值相差很多的问题 [打印本页]

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Author: chaojichaoji 时间: 2024-3-12 12:18
标题: 关于NPT过程中密度变化缓慢与实验值相差很多的问题
各位老师好，我正在使用gromacs模拟两种有机分子混合的溶液体系。首先用packmol建立了体系，能量最小化之后NPT模拟过程中密度基本不变化且与实验值相差巨大。
实验值的密度应该在800kg/m3左右。
之前使用PR控压将步长改成0.1fs之后可以慢慢到实际的密度，但是很容易崩溃。于是还是用了berendsen控压。
请问各位老师这种情况可能是什么原因导致的呢。
附件添加了em与NPT的mdp文件。谢谢各位老师。

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