计算化学公社

标题: QM/MM可以在一个分子内使用吗 [打印本页]

作者
Author: 我爱学习2022 时间: 2024-3-14 10:44
标题: QM/MM可以在一个分子内使用吗
请问各位老师，oniom模型中可以只对中心分子的某一特定位置做QM吗？

作者
Author: niobium 时间: 2024-3-14 11:35
当然可以

作者
Author: 我爱学习2022 时间: 2024-3-14 16:25

niobium 发表于 2024-3-14 11:35
当然可以

老师我想请问一下，在修改高斯脚本的时候，是选出一个作为high层的分子，把这个分子的QM部分设为0，MM部分和low层一样都是-1；还是直接只把想算QM的那一部分设为high层啊。十分期待老师的回复，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-14 21:14
首先要搞清楚ONIOM和QM/MM是两码事，仔细看下文
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问题
http://sobereva.com/597

若无绝对必要用ONIOM(QM:MM)或QM/MM，建议直接用簇模型做量化计算，省事得多

并且分清楚输入文件和脚本，完全是两个概念

作者
Author: 我爱学习2022 时间: 2024-3-15 10:16

sobereva 发表于 2024-3-14 21:14
首先要搞清楚ONIOM和QM/MM是两码事，仔细看下文
要善用簇模型，不要盲目用ONIOM算蛋白质-小分子相互作用问 ...

谢谢sob老师的回复，我针对您给出的意见仔细研究一下

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)