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标题: gromacs如何提高CPU占有率？ [打印本页]

作者
Author: ｃｌａｒｅ 时间: 2024-3-14 22:33
标题: gromacs如何提高CPU占有率？
配置是两块GPU，CPU是24核96线程，GROMACS版本是2021.4.
我使用nohup gmx mdrun -pin on -ntmpi 1 -ntomp 12 -nb gpu -v -s 3_run.tpr -deffnm 3_run &命令同时跑两个任务，cpu使用百分比两个任务分别为600%。
单卡+12核CPU跑一个任务时候，CPU占用率是1200%
使用htop查看任务，似乎是两个任务跑到一个cpu上去了。在论坛寻找解决办法看到了这个帖子[已解决]Gromacs单机GPU双卡占用率低下求助 - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社 (keinsci.com)，需要加上-pinoffse，查看了gromacs文档也不太理解这个要如何设置。
请问我的电脑要如何设置能够使得每个任务使用单卡+12核CPU？

作者
Author: abin 时间: 2024-3-15 14:03
用slurm调度，
并正确配置cgroup

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