计算化学公社

标题: 求gromacs4.5.7安装包 [打印本页]

作者
Author: 小瓶不会做计算 时间: 2024-3-15 11:26
标题: 求gromacs4.5.7安装包
各位大佬好，我做的是smog-server输出的粗粒化模型模拟，现在研究是两个蛋白间的binding/unbinding events，需要用plumed 的upper_walls功能让两蛋白保持在一定距离内，之前用gromacs2019.6，mdrun总是崩溃（加不加-plumed flag 都崩），换成gromacs 4.5.5 不加 plumed 200ns就可以完整跑完，我怀疑是gromacs v5以后对列表势不兼容导致的（MDP中我的设置是 vdwtype=User columbtype=User mdrun 时用 -table和 -tablep）。

于是我打算用gromacs v4 compile with Plumed 再试一试，发现Plumed 2.8 只能和 Gromacs 4.5.7 patch，但我在github上搜到的 Gromacs 4.5.7的包里没有configure脚本，无法进行configure，因此想向各位老师求助找一下有没有完整的Gromacs 4.5.7的安装包（有configure脚本的）。
(, 下载次数 Times of downloads: 8)

作者
Author: mizu-bai 时间: 2024-3-15 15:14
自己慢慢找

https://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/

作者
Author: 小瓶不会做计算 时间: 2024-3-15 15:26

mizu-bai 发表于 2024-3-15 15:14
自己慢慢找

https://ftp.gromacs.org/pub/gromacs/

感谢大佬！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)