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标题: 绘制AIM图时,想查询某个临界点的值求助 [打印本页]

作者
Author:
七尺贱    时间: 2024-3-18 20:44
标题: 绘制AIM图时,想查询某个临界点的值求助
本帖最后由 七尺贱 于 2024-3-18 21:02 编辑

各位老师好,我在利用Multiwfn绘制AIM图时,想查询某个临界点的值,我点击这个原子,vmd显示index: 34079,可CPprop.txt压根没有这么多值。AIM具体操作是AIM.txt文件。将文件放入了网盘,希望各位老师指点一下
链接:https://pan.baidu.com/s/1CrD--QDwa4AHYQB87V0PdA
提取码:9ncp
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mol.pdb



作者
Author:
sobereva    时间: 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html

(, 下载次数 Times of downloads: 27)
作者
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七尺贱    时间: 2024-3-18 21:01
sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445(ht ...

老师还是有问题,我是这样操作的
2  //拓扑分析
2  //以每个原子核为初猜搜索临界点
3  //以每一对原子中点为初猜搜索临界点
8  //产生键径
-5  //处理键径
8  //只保留连接两个片段间的键径和对应的BCP而删除其它的
286-290 //中心分子的原子序号
1-5,38-47,67-76,95-104,175-184,189-218,233-262  //其余分子的原子序号
y  //连接两个片段以外的键径已被删除,这里输入y也删除它们对应的BCP
6  //把当前键径导出为paths.pdb
0  //返回
-4  //修改临界点
2  //删除某些临界点
5  //删除对当前没意义的(3,+1)型临界点
6  //删除对当前没意义的(3,+3)型临界点
0  //返回
6  //把临界点导出为CPs.pdb
然后点击键临界点还是index很大
作者
Author:
七尺贱    时间: 2024-3-18 21:24
sobereva 发表于 2024-3-18 20:49
都明确说了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445(ht ...

老师我主要想看一下里面的BF4离子和外面原子相互作用的强弱
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-3-20 23:24
你没点到键径上,就不可能有那么大的index号
作者
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七尺贱    时间: 2024-3-21 15:30
sobereva 发表于 2024-3-20 23:24
你没点到键径上,就不可能有那么大的index号

好的谢谢老师




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