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标题: Amber计算RDF与氢键计算不符应怎么解释？ [打印本页]

作者
Author: wlhayx 时间: 2024-3-22 14:13
标题: Amber计算RDF与氢键计算不符应怎么解释？
各位老师好，本人在用Amber软件分析丝素蛋白和聚乙烯醇交联影响时，遇到RDF和氢键计算数据不相符的问题。
RDF在0.26-0.3mm出现峰一般表示存在氢键相互作用，数值越高氢键相互作用越强。但是算完发现这一峰值高的模型，氢键数量反而少，这应该怎么作解？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-22 16:47
氢键还有键角判据，rdf不体现。而且还得确保两种方式考虑的原子对确实有可比性

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