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标题: 如何修改showcub将不同fragment呈现不同样式 [打印本页]

作者
Author: cabbage 时间: 2024-3-22 15:53
标题: 如何修改showcub将不同fragment呈现不同样式
各位老师好，曾拜读过sob老师的“在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法”和“VMD里原子选择语句的语法和例子”，从而可以快速高效的绘制美观的等值面图，但是我的体系除了主要分子之外，还有许多溶剂分子，老师的脚本是使得所有片段的显示形式都为CPK，奈何溶剂分子过多使用这种显示方式容易喧宾夺主，我想要使溶剂分子显示为line的形式，其余分子仍为CPK的显示，并且显示等值面，不知道showcub.vmd中相关信息应该怎样编写以及插入在哪一部分中呢？我想要的形式如下图。

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作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-22 16:08
打开file - log tcl commands to console，然后设置这些rep，相应命令会显示在文本窗口里，适当调整后加入脚本里

作者
Author: cabbage 时间: 2024-3-26 10:16

sobereva 发表于 2024-3-22 16:08
打开file - log tcl commands to console，然后设置这些rep，相应命令会显示在文本窗口里，适当调整后加入 ...

谢谢社长，已经修改完成。

作者
Author: cabbage 时间: 2024-3-27 18:42

sobereva 发表于 2024-3-22 16:08
打开file - log tcl commands to console，然后设置这些rep，相应命令会显示在文本窗口里，适当调整后加入 ...

社长，我设置了之后虽然能够按照我的要求呈现图示，可是每次都要重启vmd再输入指令，才能展现出我想要的，要是直接在文本窗口改命令输入别的cub文件，呈现出的图案就不是我想要的了，请问应该怎么修改才能直接可以在文本窗口输入指令直接查看而不用每次都重启vmd呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-28 00:17

cabbage 发表于 2024-3-27 18:42
社长，我设置了之后虽然能够按照我的要求呈现图示，可是每次都要重启vmd再输入指令，才能展现出我想要的 ...

看VMD user guide详细了解那些命令的用法

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