计算化学公社

标题: 构象搜索未成功备份chk文件 [打印本页]

作者
Author:
Xiaol    时间: 2024-3-22 19:49
标题: 构象搜索未成功备份chk文件
请教大家,我开启了备份out和chk文件,请问为什么gau00001.chk文件找不到(gau00001.out正常备份了)



作者
Author:
sobereva    时间: 2024-3-22 20:36
说明运行环境(本机直接运行,还是什么方式提交的)
并且检查中途产生的gau.gjf里有没有%chk=gau.chk
作者
Author:
Xiaol    时间: 2024-3-22 20:54
本帖最后由 Xiaol 于 2024-3-22 21:03 编辑
sobereva 发表于 2024-3-22 20:36
说明运行环境(本机直接运行,还是什么方式提交的)
并且检查中途产生的gau.gjf里有没有%chk=gau.chk

qsub run.pbs到服务器提交运行
-----run.pbs------
#!/bin/bash
#PBS -N LHR1_molclus
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=336:00:00
#PBS -q normal
#PBS -o jobID.$PBS_JOBID


pwd
cd  /public/home/lihr1/molclus_1.12_Linux


molclus
sleep 60
------------------

gau.gjf中有%chk=gau.chk
-----gau.gjf------
%chk=gau.chk
%chk=template
%nprocs=16
%mem=32GB
# B3LYP/6-31G* em=GD3BJ opt freq


Template file


0 1

...
------------------

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-3-23 09:21
Xiaol 发表于 2024-3-22 20:54
qsub run.pbs到服务器提交运行
-----run.pbs------
#!/bin/bash

%chk显然不能出现两遍,%chk=template是完全多余的。molclus的模板文件你写的不对
作者
Author:
Xiaol    时间: 2024-3-23 11:11
sobereva 发表于 2024-3-23 09:21
%chk显然不能出现两遍,%chk=template是完全多余的。molclus的模板文件你写的不对

谢谢卢老师,我试试




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