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标题: GROMACS程序中苯并芘、四环素建模文件求助 [打印本页]

作者
Author: 熊小熊 时间: 2024-3-25 11:14
标题: GROMACS程序中苯并芘、四环素建模文件求助
大家好，我是研究有害物质与磷脂双分子层相互作用的课题的，磷脂分子采用的的CHARMMM力场文件，现在想要四环素和苯并芘的itp文件和gro文件，我自己尝试生成时，主要问题就在苯环的处理上，想问问有那位朋友可以分享吗？非常感谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-25 11:34
sobtop (http://sobereva.com/soft/Sobtop)创建基于GAFF力场的苯并芘、四环素的拓扑文件，结合slipid或者lipid17力场描述磷脂，非常理想，且不绕弯路

作者
Author: 熊小熊 时间: 2024-3-26 21:41
好的，我试试，谢谢您！

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