计算化学公社

标题: 询问如何更改gromacs力场的调用目录 [打印本页]

作者
Author: Allan_Zhang 时间: 2024-3-25 14:18
标题: 询问如何更改gromacs力场的调用目录
我在下载力场的时候，gromacs软件自带力场部分是显示permission denied，所以我打算自己新建一个力场目录，在.bashrc中更改的为export GMXLIB=/lustre/home/gsklujlab2/zhanglin/gromacs/ff/top:$GMXLIB
但是当我输入gmx pdb2gmx 命令的时候显示如下图所示，显示文件是空的，这个情况我该怎么办？
(, 下载次数 Times of downloads: 20)

作者
Author: Allan_Zhang 时间: 2024-3-25 14:19
在未修改GMXLIB=/lustre/home/gsklujlab2/zhanglin/gromacs/ff/top:$GMXLIB 这个时，就能正常调用

作者
Author: lmch 时间: 2024-3-26 05:15
你不如把力场文件移到工作目录
使用./xxx

或者../../xxx之类的

也可以echo $GMXLIB 看看出来的是啥

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)