计算化学公社

标题: 求助:用MRCI做势能面扫描报错 [打印本页]

作者
Author:
Lapheal    时间: 2024-3-27 00:36
标题: 求助:用MRCI做势能面扫描报错
本帖最后由 Lapheal 于 2024-4-26 16:39 编辑

想要在orca中用FIC-MRCI做刚性扫描,扫描键长获得解离曲线。输入文件和报错如下,输入文件中%autoci模块是照着手册写的,请问这部分有误吗?

ORCA finished by error termination in MRCI
Calling Command: mpirun -np 4  /shared/software/chem/orca/5.0.4/orca_mrci_mpi scan.mrciinp scan
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
  .... aborting the run







作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-3-27 04:19
stderr里面说得很清楚了,Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.很可能是内存不够。
建议确认一下你是否真的有200000MB*4=800GB的物理内存,如果没有这么多,减小maxcore再试。
另外扫描的步长这么小的话,估计永远也算不完。一般每0.05埃一步就已经很精细了,如果需要把哪里扫得更精细一些(例如接近平衡键长的地方),再单跑一个任务专扫那一块。
作者
Author:
Lapheal    时间: 2024-3-27 07:05
wzkchem5 发表于 2024-3-27 04:19
stderr里面说得很清楚了,Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory hand ...

感谢老师答疑!
1)修改了步长,改为R= 5.0,1.0,80
2)机子有1024G的物理内存。尝试了50000MB*4=200GB,20000MB*4=80GB,任务都会在跑到00:07时准时停止报同样的错,得到相同的输出文件。200000MB*1=200GB,尝试了单核也是同样的报错。但是把%mrci模块删掉只算casscf就可以在200000MB*4=800GB成功运行。请问老师有什么建议吗?
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-3-27 17:19
Lapheal 发表于 2024-3-27 00:05
感谢老师答疑!
1)修改了步长,改为R= 5.0,1.0,80
2)机子有1024G的物理内存。尝试了50000MB*4=200GB ...

硬盘空间够吗?
作者
Author:
Lapheal    时间: 2024-3-28 16:47
wzkchem5 发表于 2024-3-27 17:19
硬盘空间够吗?

谢谢老师。在提交任务的脚本里设置了每核的内存后可以成功运行了




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3