计算化学公社
标题:
关于读取密度文件能做哪些分析的问题
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作者Author:
仰望星空hong
时间:
2024-3-28 02:07
标题:
关于读取密度文件能做哪些分析的问题
你好Sob老师,
我想问下如果我只有一个cube文件,里面存储了电子云密度,那么我都可以做哪些分析?我相信这个问题可能很多人都有。毕竟很多软件能导出密度。
我感觉Multiwfn是不理解输入文件具体内容的,所以必须在人为控制的情况下才能做一些分析,比如定义一个范围然后让它积分范围内密度之类的。
那么能不能劳烦大概例举一下都能做什么分析呀?说实话说明书太牛了,我只能学会一些,但是知识面就没有那么广,还差得远。我也就想到画个区域然后把区域中密度进行积分这种简单的操作。另外想到可以算Delta_g,但应该是不需要密度,所以这个也不算数。还有就是可以算ESP,但目前还没整明白怎么只用密度进行操作。其他就不知道了,麻烦给指点一下吧!谢谢!
作者Author:
sobereva
时间:
2024-3-28 02:41
光有电子密度cube文件能做的分析极少,基本上没什么用处,在Multiwfn里也就是对电子密度做盆分析算AIM电荷,或者和其它记录密度的cube文件求差绘制密度差图之类的
Multiwfn里有很多分析只需要体系结构信息,比如IGM、范德华势、准分子近似的NCI、原子对色散能的贡献、Hirshfeld surface方向、各种基于几何结构的分析(如平面性),等等,但这不直接使用从cube文件里读到的密度信息。
我不觉得会有什么情况非得只能提供电子密度的cube文件。孤立体系用Gaussian、ORCA等量化程序很容易就能得到波函数文件,周期性体系用免费又高效的CP2K也是很容易就能得到波函数文件。
作者Author:
仰望星空hong
时间:
2024-3-28 23:28
好的,谢谢老师。但有的时候用VASP,它是平面波基组,但密度可以导出变成cube文件,正好拿到multiwfn里面来用。所以就问问看能不能说分析的深入一点。
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