计算化学公社

标题: DP-Gen在计算初始数据集时出现文件格式相关问题的报错 [打印本页]

作者
Author:
liweiiqi    时间: 2024-3-29 14:29
标题: DP-Gen在计算初始数据集时出现文件格式相关问题的报错
本帖最后由 liweiiqi 于 2024-3-29 14:30 编辑



    请教老师们,在使用DP-Gen产生初始数据集(即dpgen init_bulk)时,出现了如下报错,说我的poscar文件的格式不对。我用MP网站上下载或从VESTA中导出的POSCAR都出现了如下报错。param.json文件我是直接用的官网的。如下:
{   
    "stages" : [1,2,3,4],   
    "elements": ["Li","Si"],   
     "cell_type": "diamond",   
    "latt": 10.0,   
    "super_cell": [1, 1, 1],   
    "from_poscar": true,   
    "from_poscar_path": "./LiSi.POSCAR",   
    "potcars": ["./POTCAR_Li", "./POTCAR_Si"],   
    "relax_incar": "./INCAR_rlx",   
    "md_incar" : "./INCAR_md",   
    "skip_relax": false,   
    "scale": [1.00],   
    "pert_numb": 4,   
    "pert_box": 0.03,   
    "pert_atom": 0.01,   
    "md_nstep" : 10,   
    "coll_ndata": 5000,   
    "type_map" : ["Li","Si"],   
    "_comment": "that's all"
}
    另外,machine.json测试后是可用的(在别的案例中使用dpgen run是可行的)。

    报错如下:



作者
Author:
liweiiqi    时间: 2024-3-29 17:57
解决啦:
pymatgen版本和dp-gen不兼容,我直接重新找了个环境安装了dpgen后就好了。
作者
Author:
朱雪刚    时间: 2024-4-4 11:27
我最近在写DPGEN+ABACUS+LAMMPS+DeePMD的使用教程,希望有人帮忙看一下给一些建议,目前在飞书文档https://ucoyxk075n.feishu.cn/doc ... ?from=from_copylink




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3