计算化学公社
标题:
DP-Gen在计算初始数据集时出现文件格式相关问题的报错
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作者Author:
liweiiqi
时间:
2024-3-29 14:29
标题:
DP-Gen在计算初始数据集时出现文件格式相关问题的报错
本帖最后由 liweiiqi 于 2024-3-29 14:30 编辑
请教老师们,在使用DP-Gen产生初始数据集(即dpgen init_bulk)时,出现了如下报错,说我的poscar文件的格式不对。我用MP网站上下载或从VESTA中导出的POSCAR都出现了如下报错。param.json文件我是直接用的官网的。如下:
{
"stages" : [1,2,3,4],
"elements": ["Li","Si"],
"cell_type": "diamond",
"latt": 10.0,
"super_cell": [1, 1, 1],
"from_poscar": true,
"from_poscar_path": "./LiSi.POSCAR",
"potcars": ["./POTCAR_Li", "./POTCAR_Si"],
"relax_incar": "./INCAR_rlx",
"md_incar" : "./INCAR_md",
"skip_relax": false,
"scale": [1.00],
"pert_numb": 4,
"pert_box": 0.03,
"pert_atom": 0.01,
"md_nstep" : 10,
"coll_ndata": 5000,
"type_map" : ["Li","Si"],
"_comment": "that's all"
}
另外,machine.json测试后是可用的(在别的案例中使用dpgen run是可行的)。
报错如下:
作者Author:
liweiiqi
时间:
2024-3-29 17:57
解决啦:
pymatgen版本和dp-gen不兼容,我直接重新找了个环境安装了dpgen后就好了。
作者Author:
朱雪刚
时间:
2024-4-4 11:27
我最近在写DPGEN+ABACUS+LAMMPS+DeePMD的使用教程,希望有人帮忙看一下给一些建议,目前在飞书文档
https://ucoyxk075n.feishu.cn/doc ... ?from=from_copylink
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