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标题: Multiwfn和VMD做静电势分析时遇到极值点不一致问题怎么解决 [打印本页]

作者
Author: scientist-HRL 时间: 2024-3-31 19:46
标题: Multiwfn和VMD做静电势分析时遇到极值点不一致问题怎么解决

The number of surface minima: 8

# a.u. eV kcal/mol X/Y/Z coordinate(Angstrom)

1 -0.01311380 -0.356845 -8.229038 -3.200595 -0.084042 -1.928015

2 -0.01312232 -0.357076 -8.234384 -3.188445 -0.072267 1.926901

3 -0.02451537 -0.667097 -15.383638 -0.544916 0.721306 1.921735

4 -0.02477671 -0.674208 -15.547630 -0.017346 0.319862 1.917324

5 -0.02477854 -0.674258 -15.548780 -0.008180 0.312336 -1.919000

6 -0.03290277 -0.895330 -20.646816 2.334118 -2.335474 1.200933

7 -0.03291459 -0.895651 -20.654233 2.381666 -2.301850 -1.248980

* 8 -0.06256848 -1.702575 -39.262347 3.362116 2.759602 0.008859

Thenumber of surface maxima: 6

# a.u. eV kcal/mol X/Y/Z coordinate(Angstrom)

* 1 0.07219178 1.964438 45.301063 -4.733985 -1.876726 -0.004777

2 0.07178679 1.953418 45.046928 -4.683428 1.839310 0.001087

3 0.01525069 0.414992 9.569962 0.196147 -3.439953 0.013740

4 -0.00254787 -0.069331 -1.598815 2.224343 -0.083598 -1.794216

5 -0.00257785 -0.070147 -1.617628 2.235737 -0.071718 1.794282

6 0.06667832 1.814409 41.841312 4.892312 -0.994000 0.051720

multiwfn计算分子表面分析得到的极值点数据如上，极小值有8个，VMD显示的极值点如附图，极小值有7个，这个问题应该怎么解决，求大佬指点

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-31 21:56
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）
文中写得明明白白

常有人问为什么他通过ext命令绘制出的分子表面静电势极值点的数目和他自己在Multiwfn里用主功能12做静电势的定量分子表面分析给出的不符，这是因为ESPext.bat脚本把格点间距设成了0.15 Bohr，而Multiwfn默认用的是0.25 Bohr。格点间距越小表面顶点确定得越准确。显然不符的时候，通过ESPext.bat给出的更准。如果想要二者结果一样，在Multiwfn主功能12里进行计算前先选选项3修改格点间距为0.15 Bohr即可。

作者
Author: scientist-HRL 时间: 2024-4-1 00:40

sobereva 发表于 2024-3-31 21:56
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva. ...

我得到想要的结果了，谢谢大神

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