计算化学公社

标题: gromacs真空模拟聚合物出现真空区域没有自发消除问题 [打印本页]

作者
Author: MGRACE 时间: 2024-4-4 11:11
标题: gromacs真空模拟聚合物出现真空区域没有自发消除问题
步骤是先升温后退火模拟，都使用了压浴，拓扑文件使用sobtop生成

作者
Author: Lacrimosa 时间: 2024-4-4 13:56
一般延长模拟时间就能解决了

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-4 16:20
把压浴时间常数设小、让压浴作用效果表现得更显著，也可以暂时性加大可压缩系数，以尽可能在较短时间内令盒子尺寸收缩合适。等真空区消差不多了，再改成原本的压浴参数。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)