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标题: 使用Spartan时遇到的的问题 [打印本页]

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sselpah    时间: 2016-11-11 09:48
标题: 使用Spartan时遇到的的问题
老师您好,我看了论坛里的“如何进行构象搜索以获得量化计算的初始结构”的帖子,学着用了一下Spartan软件。我想解决的是环戊酮羰基邻位上的异丙基的最优构象问题,Spartan给出了3个构象以及相应的能量(玻尔兹曼分布)排序,我分别导出后用Gaussian 09计算其能量,发现排序和Spartan给出的不完全相同(Spartan计算的排序是1,2,3而Gaussian计算的排序是2,1,3),请问出现这样的问题的原因是什么?如何解决?谢谢老师。
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sobereva    时间: 2016-11-11 13:03
Gaussian计算用的计算级别和Spartan构象搜索时完全一样否?
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sselpah    时间: 2016-11-11 14:02
sobereva 发表于 2016-11-11 13:03
Gaussian计算用的计算级别和Spartan构象搜索时完全一样否?

不完全一样,spartan我是按照那个帖子里面建议的参数来算的,conformer distribution at ground state with Molecular Mechanics(MMFF)。Gsussian用的是b3lyp/def2TZVP
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sselpah    时间: 2016-11-11 14:06
sobereva 发表于 2016-11-11 13:03
Gaussian计算用的计算级别和Spartan构象搜索时完全一样否?

我当时想的是,用spartan只是希望得到一个能量最低的初始结构,之后放到Gaussian里面算能量。而且用自己的普通笔记本在Spartan里面用DFT/b3lyp/6-31++G**的话cpu都100%了
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sobereva    时间: 2016-11-11 21:11
sselpah 发表于 2016-11-11 14:06
我当时想的是,用spartan只是希望得到一个能量最低的初始结构,之后放到Gaussian里面算能量。而且用自己 ...

级别不一样,当然算出来能量顺序往往不同。你要算构象能量差,起码M062X/def2SVP,好点就用TZVP。加弥散纯属多余,白浪费时间,
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sselpah    时间: 2016-11-12 19:35
sobereva 发表于 2016-11-11 21:11
级别不一样,当然算出来能量顺序往往不同。你要算构象能量差,起码M062X/def2SVP,好点就用TZVP。加弥散 ...

谢谢老师!




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