计算化学公社

标题: 离子液体体系的MSD的计算问题 [打印本页]

作者
Author:
huashang    时间: 2024-4-4 19:29
标题: 离子液体体系的MSD的计算问题
各位老师好,我是在体系平衡以后,在NVT下进行了5ns的模拟,来计算体系的MSD的。结果我发现体系的MSD在1ns之后变成了一条直线。我想问一下:这种情况是否正常?如果不正常的话,该如何解决?
作者
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Lacrimosa    时间: 2024-4-4 20:33
看起来扩散系数非常小,感觉分子都没在动,你打开轨迹确认一下
作者
Author:
huashang    时间: 2024-4-4 21:05
Lacrimosa 发表于 2024-4-4 20:33
看起来扩散系数非常小,感觉分子都没在动,你打开轨迹确认一下

我观察了轨迹,的确分子的变化幅度都很小,请问:是不是因为该离子液体扩散系数太低,MSD图才会变成这样?
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-4-5 02:32
很可能温度太低,都没超过凝固点,或者力场参数问题,导致凝固点过高




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