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标题: 拓扑文件应该是拿扩胞后的单个分子进行参数的生成还是直接用单胞进行参数的生成 [打印本页]

作者
Author: wanzongliang 时间: 2024-4-5 12:12
标题: 拓扑文件应该是拿扩胞后的单个分子进行参数的生成还是直接用单胞进行参数的生成
各位老师号，我想用gromacs跑一个HOF的平衡，我已经得到了这个材料的单胞，准备用sobtop生成他的力场参数，我将单胞扩胞之后的样子如图所示，请问一下各位老师我应该是拿扩胞后样子的单个分子进行参数的生成还是直接用单胞进行参数的生成就可以

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-5 18:13
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “gromacs建模问题” 改了，以后务必注意！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-5 18:14
必须对单个分子生成。参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ4

作者
Author: wanzongliang 时间: 2024-4-6 09:03

sobereva 发表于 2024-4-5 18:14
必须对单个分子生成。参考http://sobereva.com/soft/Sobtop#FAQ4

好的老师，下次会注意，感谢老师

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