计算化学公社

标题: uspex安装问题 [打印本页]

作者
Author:
jingetiema6112    时间: 2024-4-6 21:39
标题: uspex安装问题
本帖最后由 jingetiema6112 于 2024-4-6 22:01 编辑

请教各位老师,按照教程在win下安装好linux后,安装USPEX 提示以下问题。虽然最后提示安装成功,但是输入USPEX -h进行检查的时候,有提示找不到指令。这种情况是安装成功了吗?


作者
Author:
logzzz    时间: 2024-4-7 10:14
环境变量有改么?另外,我还好像记得USPEX要求python3.9的环境。
作者
Author:
jingetiema6112    时间: 2024-4-7 11:06
logzzz 发表于 2024-4-7 10:14
环境变量有改么?另外,我还好像记得USPEX要求python3.9的环境。

谢谢老师解答,我就是按照教程安装了linux虚拟机,然后现在这个软件,按照教程一步步走下来的,就是这个结果。初步学习这东西,折腾好几天了......
作者
Author:
logzzz    时间: 2024-4-7 12:35
jingetiema6112 发表于 2024-4-7 11:06
谢谢老师解答,我就是按照教程安装了linux虚拟机,然后现在这个软件,按照教程一步步走下来的,就是这个 ...

看USPEX的README,里面写的很清楚了。需要设置环境变量。
*** For updating USPEX using "USPEX -u", "requests" and "zipfile" libraries
must be installed for python3.

****************************************************
***            (1) INSTALLATION                  ***
****************************************************
* For Installation of USPEX + MCR(R2016b) you need
to run install.sh and follow the instruction.

      ./install.sh

* If you  want  to  install  the  codes in  the root
partition then you need to run install.sh as follow:

      sudo ./install.sh

* It is  essential to  run  the following command to
avoid  encountering   errors   when  running  USPEX
examples and make working with USPEX more pleasant.

      chmod +rw -R  /installation path of USPEX/application/archive/

****************************************************
***     (2) Setup the environment variables      ***
****************************************************
* If you  choose  graphical installation,  you must
setup environmental variables manually (in terminal
installation, the  environmental variables would be
added automatically).

Setup  the  environment variables for MATLAB runtime
and USPEX by adding the following path to the bashrc
file.


For Bash shell system, add these lines in ~/.bashrc or ~/.profile or /etc/profile:

export MCRROOT=/installation PATH of MCR/
export PATH=/installation PATH of USPEX/application/archive/:$PATH
export USPEXPATH=/installation PATH of USPEX/application/archive/src


For C shell system, add these lines in ~/.cshrc or ~/.profile or /etc/profile:

setenv MCRROOT "/installation PATH of MCR/"
setenv PATH "/installation PATH of USPEX/application/archive/:$PATH"
setenv USPEXPATH "/installation PATH of USPEX/application/archive/src"

按着说明一步步来,另外,我给calypso打广告。这个更易上手和使用。我个人见解。
作者
Author:
jingetiema6112    时间: 2024-4-7 12:46
logzzz 发表于 2024-4-7 12:35
看USPEX的README,里面写的很清楚了。需要设置环境变量。
*** For updating USPEX using "USPEX -u", "r ...

收到,谢谢老师指导,我再看下
作者
Author:
bqcao    时间: 2024-4-7 20:08
安装的时候我也遇到了同样的问题,楼主的问题(USPEX -h无回应)似乎通过source ~/.bashrc就可以解决,但是我搜结构的时候会报错。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3