计算化学公社

标题: 安装packmol过程中出现问题 [打印本页]

作者
Author: 2421886719 时间: 2024-4-7 14:17
标题: 安装packmol过程中出现问题
各位老师好，
   我在Rocky Linux 8.6系统安装packmol，首先在官网下载名为packmol-20.14.3.tar.gz的文件，解压后在终端使用make编译；
   报错显示"make: /usr/bin/gfortran: Command not found make: *** [Makefile:122: exit_codes.o] Error 127"，查资料发现应该是电脑上没有gfortran编译器；
   于是使用指令”yum install gcc”安装gfortran；
   报错“Error: Failed to download metadata for repo 'xcat-core': repomd.xml parser error: Parse error at line: 137 (xmlParseEntityRef: no name)”
   使用指令“yum install gcc-gfortran”也是同样的报错；
   想请问一下这个该怎么解决？

作者
Author: abin 时间: 2024-4-7 14:27
dnf makecache

如果提示错误，那么请删除系统上的*.repo
然后使用如下的repo

https://gitee.com/hpc4you/linux/ ... rocky8-hpc4you.repo

你要修改的文件在
/etc/yum.repos.d路径
大概这个路径，可能有写错一两个字母……

作者
Author: 2421886719 时间: 2024-4-7 14:43

abin 发表于 2024-4-7 14:27
dnf makecache

如果提示错误，那么请删除系统上的*.repo

谢谢老师！我照您说的dnf makecache果然出现了一样的报错，然后进入您说的路径，发现里面有很多repo后缀的文件，比如“Rocky-AppStream.repo Rocky-BaseOS.repo Rocky-Debuginfo.repo Rocky-Extras.repo”，还有很多repo.bak文件，我是计算机小白，不太懂要修改什么，是所有repo后缀的文件都要删除吗？repo.bak的文件要删除吗？

作者
Author: abin 时间: 2024-4-7 15:54
本帖最后由 abin 于 2024-4-7 15:56 编辑

2421886719 发表于 2024-4-7 14:43
谢谢老师！我照您说的dnf makecache果然出现了一样的报错，然后进入您说的路径，发现里面有很多repo后缀 ...

至少在教育网是可用的。其他网络未充分测试。
如果是所谓的Linux小白的话，去这个链接 https://space.bilibili.com/470332016/channel/series
这几个相关的视频浏览一下，可以避免很多弯路。

su -
mkdir /etc/yum.repos.d/bak
mv /etc/yum.repos.d/*.* /etc/yum.repos.d/bak
curl https://gitee.com/hpc4you/linux/raw/master/repos/rocky8/rocky8-hpc4you.repo > /etc/yum.repos.d/rocky8-hpc4you.repo
dnf makecache

复制代码

作者
Author: 2421886719 时间: 2024-4-10 11:04

abin 发表于 2024-4-7 15:54
至少在教育网是可用的。其他网络未充分测试。
如果是所谓的Linux小白的话，去这个链接 https://spac ...

谢谢老师，问题已经解决了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)