计算化学公社

标题: CI-NEB任务经常某一步优化时间很长 [打印本页]

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wangs    时间: 2024-4-7 15:24
标题: CI-NEB任务经常某一步优化时间很长
各位老师好,我用CP2K的CI-NEB计算钾离子在蒙脱土表面迁移的能垒,插点数为8个,每个点用12核进行计算,在2*7R32服务器上进行计算,正常来看,NEB进行一步大概是一分钟左右,但是经常进行到某一步时,过了12小时还是不更新下一步的计算,查看每个点的cp2k-BAND.out文件,SCF也是正常收敛的. (, 下载次数 Times of downloads: 6) (, 下载次数 Times of downloads: 20) 从昨晚进行到第60步,一直到现在,仍然是第60步

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sobereva    时间: 2024-4-8 02:57
从副本的out文件末尾往前一点点看,判断当前计算情况
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wangs    时间: 2024-4-9 11:19
sobereva 发表于 2024-4-8 02:57
从副本的out文件末尾往前一点点看,判断当前计算情况

多谢老师的解答,通过查看cp2k-BAND6.out文件,发现其SCF收敛,但是通过提取最后的总能量作图,发现其一直在均匀的震荡 (, 下载次数 Times of downloads: 19)
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sobereva    时间: 2024-4-10 03:09
尝试调节&BAND / &OPTIMIZE_BAND里的相关设置
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yanleshan    时间: 2026-3-12 20:18
您好,请问问题解决了吗?我也遇到相同情况,cp2k长时间不更新下一步band步,我检查最新轨迹未有原子间距过小问题,我怀疑是过早开启Climbing Image以及BAND步长过大导致的,目前调整后正在观察中
作者
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Wednesday    时间: 2026-4-2 17:16
yanleshan 发表于 2026-3-12 20:18
您好,请问问题解决了吗?我也遇到相同情况,cp2k长时间不更新下一步band步,我检查最新轨迹未有原子间距过 ...

您好,解决了么?
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Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2026-4-2 18:22
Wednesday 发表于 2026-4-2 17:16
您好,解决了么?

你的体系有多大,用了几个进程几个核心并行的?

这个问题虽然有人提过https://github.com/cp2k/cp2k/issues/4925,但是没有一个比较小巧的案例快速稳定复现的话也不方便排查整改。
作者
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Wednesday    时间: 2026-4-2 18:43
本帖最后由 Wednesday 于 2026-4-2 18:44 编辑
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2026-4-2 18:22
你的体系有多大,用了几个进程几个核心并行的?

这个问题虽然有人提过https://github.com/cp2k/cp2k/i ...

老师您好,我的体系308个原子,11个进程每个进程8个核心跑的,具体的输入和输出文件在我的贴下都有




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