计算化学公社

标题: 使用vmd插件计算空间分布函数时遇到问题 [打印本页]

作者
Author:
ngaoo    时间: 2024-4-7 16:21
标题: 使用vmd插件计算空间分布函数时遇到问题
本帖最后由 ngaoo 于 2024-5-8 09:42 编辑

老师,这是我用volmape插件分析的中心分子(A)周围两个分子(B,C)的分布情况,不同颜色代表不同的分子,请问老师这样能说明这两种分子的空间分布问题吗?
1. A分子的isovalue为0.07,占的等值面面积为橙色的部分,B分子的isovalue为0.04,占的等值面面积为紫色的部分
可以根据不同isovalue值对应的等值面面积的大小说明分子的分布情况吗?等值面面积越大分布越多吗?


作者
Author:
sobereva    时间: 2024-4-8 03:01
能说明分布情况

面积不能说明分布多少。空间分布函数的全空间积分值是粒子总数,从这个角度理解等值面图的含义
作者
Author:
ngaoo    时间: 2024-4-8 09:07
sobereva 发表于 2024-4-8 03:01
能说明分布情况

面积不能说明分布多少。空间分布函数的全空间积分值是粒子总数,从这个角度理解等值面图 ...

谢谢老师




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