计算化学公社

标题: 羟基化SIO2后H原子不被识别 [打印本页]

作者
Author: Dalin 时间: 2024-4-7 21:25
标题: 羟基化SIO2后H原子不被识别
(, 下载次数 Times of downloads: 21) (, 下载次数 Times of downloads: 22) (, 下载次数 Times of downloads: 20) (, 下载次数 Times of downloads: 22) (, 下载次数 Times of downloads: 20) 各位老师，我刚学习GROMACS不久，想通过sobtop创建top文件，我的模型是一个羟基化后的SIO2球模型，但是sobtop无法识别H原子，麻烦各位老师指点一二，感激！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-8 03:19
我这里sobtop全都识别了
(, 下载次数 Times of downloads: 24)

(, 下载次数 Times of downloads: 22)

作者
Author: Dalin 时间: 2024-4-8 12:02

sobereva 发表于 2024-4-8 03:19
我这里sobtop全都识别了

感谢sob老师，我找到问题原因了，因为我把assign_AT.dat文件没有放在sobtop程序的目录里所以导致无法识别。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)