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标题: Desmond周期性边界出错导致配体在溶液内外跳动 [打印本页]

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Author: Azrael 时间: 2024-4-8 16:32
标题: Desmond周期性边界出错导致配体在溶液内外跳动
各位老师，使用Desmond跑完动力学模拟后，发现轨迹显示原本应该结合到蛋白质口袋里的配体，在结合口袋和溶液内外反复跳跃，这个大概率是周期性边界的问题，AMBER用cpptraj的autoimage命令就可以解决，但是desmond该如何解决呢？

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