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标题: 使用Plumed如何从SMD中功转换得到PMF [打印本页]

作者
Author: lucky1999 时间: 2024-4-9 11:08
标题: 使用Plumed如何从SMD中功转换得到PMF
各位老师，我采用gmx和plumed实现了SMD，plumed输出文件中有功输出，请问如何从功转换成PMF？plumed中有相应的语句实现该功能吗？是否需要自己写程序实现上述转换？

作者
Author: 那年冬天风在吹 时间: 2024-8-24 10:48
请问，有没有plumed做SMD的参考教程？

作者
Author: lucky1999 时间: 2024-8-24 14:05

那年冬天风在吹发表于 2024-8-24 10:48
请问，有没有plumed做SMD的参考教程？

可参考PLUMED中的教程https://www.plumed.org/doc-v2.1/user-doc/html/belfast-5.html

作者
Author: 1154975925 时间: 2024-8-24 14:34
同求

作者
Author: lucky1999 时间: 2024-8-24 15:01

1154975925 发表于 2024-8-24 14:34
同求

可参考PLUMED中的教程https://www.plumed.org/doc-v2.1/user-doc/html/belfast-5.html

作者
Author: elpa 时间: 2025-12-9 13:38
请教楼主解决了吗

作者
Author: lucky1999 时间: 2025-12-9 23:04

elpa 发表于 2025-12-9 13:38
请教楼主解决了吗

好久远的事啦

你可以去了解一下Jarzynski公式，当时我是用这个公式自己写程序实现的。

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