计算化学公社

标题: 如何针对CO2溶解度的计算与建模？ [打印本页]
作者
Author: moni0823    时间: 2024-4-9 21:48
标题: 如何针对CO2溶解度的计算与建模？
各位老师同学好，我最近在研究CO2在甲醇中的溶解度的模拟，我检索了一些文献，但是在这些文献中对于建模的描述都十分模糊，如下，都提到使用packmol去进行建模，但是我有一个疑问就是我怎么保证填充进去的是饱和的，难道是需要一次次去试，直到添加到报错不能添加为止嘛？如果各位老师同学也有对此有研究的，想请教一下你们如何去分析溶解度的，如何去建模的？
  1. Packmol is used to prepare the simulation boxes of the initial parameters of substances used in the simulation process.
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  1. The ILs, tert-butyl alcohol and n-heptane molecules were set to 440, 350 and 550 respectively according to a certain proportion to construct the simulation system. The packmol program to put ILs, tertiary butanol, and n-heptane in the same simulation box, fill the two ends of the cube box.
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作者
Author: sobereva    时间: 2024-4-9 22:06
一次次试，或者根据已知的密度信息确定填入的分子数。对于NPT，也不需要过于讲究，NPT可以自发调节盒子尺寸变成该有的密度
作者
Author: moni0823    时间: 2024-4-10 10:00
本帖最后由 moni0823 于 2024-4-10 10:34 编辑
sobereva 发表于 2024-4-9 22:06
一次次试，或者根据已知的密度信息确定填入的分子数。对于NPT，也不需要过于讲究，NPT可以自发调节盒子尺寸 ...

好的，非常感谢sob老师的解答，但是我还有一个疑问，使用gromacs在计算溶解度的时候，除了上述的建模方法，还有其他一些比较常见的方法去建模并计算溶解度？



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