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标题: acpype命令出现错误 [打印本页]

作者
Author: 中暑的阿宅w 时间: 2024-4-10 18:13
标题: acpype命令出现错误
我正在学习分子模拟。在采用acpype.py文件计算时遇到命令错误如下：

[root@localhost RBD2mer]# chmod +x acpype.py
[root@localhost RBD2mer]# ./acpype.py -i 2mer.mol2 -n -3
============================================================================
| ACPYPE: AnteChamber PYthon Parser interfacE v. 0 0 Rev: 0 (c) 2024 AWSdS |
============================================================================
WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [Errno 2] No such file or directory: 'tmp'
Total time of execution: less than a second

该贴相关问题在http://bbs.keinsci.com/thread-28417-1-1.html题主部分也有出现，但是我检查了mol2文件似乎并无问题。
附件中是mol2文件和acpype.py文件。麻烦各路大神帮我一下。

作者
Author: 中暑的阿宅w 时间: 2024-4-10 18:18
修正：报错应为
WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [Errno 2] No such file or directory: 'tmp'

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-10 22:43

中暑的阿宅w 发表于 2024-4-10 18:18
修正：报错应为
WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [E ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

改用sobtop (http://sobereva.com/soft/Sobtop)产生拓扑文件，好用多了，不仅明显更灵活强大，还没那么多破毛病和局限性。acpype已经过时了

作者
Author: 中暑的阿宅w 时间: 2024-4-18 19:54

sobereva 发表于 2024-4-10 22:43
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

好的，之后一定注意。感谢

作者
Author: 中暑的阿宅w 时间: 2024-4-18 19:54

sobereva 发表于 2024-4-10 22:43
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

好的之后一定注意
万分感谢sob老师

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