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标题: 如何查找形成β氢消除4元环过程的过渡态 [打印本页]

作者
Author: xdyjiay 时间: 2024-4-10 23:13
标题: 如何查找形成β氢消除4元环过程的过渡态
反应历程推测是，图中化合物脱去一个乙酸分子，空出的配位点要和氢形成四元环过渡态，但一直找不到合适的过渡态，请问大家这应该怎么处理？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-4-10 23:30
没明白你具体要算什么，这个分子里有一个乙酸分子和一个乙酸根，你想说的是那个乙酸分子从配合物上解离？那不需要四元环过渡态也可以解离啊

作者
Author: sai77 时间: 2024-4-11 08:55
是跟旁边亚甲基上的氢消除吗？做一个柔性扫描就可以了，H-Pd距离缩短
这是我之前一个反应的β-H消除的过渡态，也是Pd催化，原子间距离作为参考

作者
Author: xdyjiay 时间: 2024-4-11 23:38
本帖最后由 xdyjiay 于 2024-4-11 23:39 编辑

wzkchem5 发表于 2024-4-10 23:30
没明白你具体要算什么，这个分子里有一个乙酸分子和一个乙酸根，你想说的是那个乙酸分子从配合物上解离？那 ...

好的，老师，整个过程是，pd连接一个乙酸和一个乙酸根，脱去一个乙酸分子之后，空出了乙酸占的那个配位点（见新上传图片），然后再形成一个四元环过渡态，实现β氢消除
形成四元环过渡态是为了实现β氢消除，乙酸分子从配合物上解离是形成四元环的前一步
我想算的是这个四元环过渡态，可能描述的不是很清楚，不好意思，老师。
我在算的过程中吡啶上面的氮会影响pd，使其因位阻原因很难形成四元环过渡态

作者
Author: xdyjiay 时间: 2024-4-11 23:41

sai77 发表于 2024-4-11 08:55
是跟旁边亚甲基上的氢消除吗？做一个柔性扫描就可以了，H-Pd距离缩短
这是我之前一个反应的β-H消除的过渡 ...

是的，和旁边亚甲基上的氢消除，好的好的，谢谢老师，我试一下柔性扫描

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