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标题: 冻结原子模拟报错求助 [打印本页]

作者
Author: a-Student 时间: 2024-4-12 00:45
标题: 冻结原子模拟报错求助
本帖最后由 a-Student 于 2024-4-15 10:45 编辑

各位老师，请教下，如图我想固定两个N原子，mdp文件输入如下，但是报错，请问老师有什么解决方法吗？冻结的话是不是还得定义索引呀？麻烦给位老师帮我更正下，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-12 06:16
Y Y Y只是对第一个组定义了三个方向的冻结，你当前有两个冻结组，如果都是各个方向冻结，要写成Y Y Y Y Y Y
另外，如果你没提供索引文件，必须提供索引文件对那两个组进行定义

没事甭用constraints = all-bonds，论坛里我都批过N次了

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