标题: 分子吸附优化后，盒子边原子消失不见 [打印本页] 作者Author: jiandan 时间: 2024-4-14 16:10 标题: 分子吸附优化后，盒子边原子消失不见 老师好，我用VASP计算NiSe表面吸附时，固定底面原子，结构优化结束后发现盒子边原子有部分缺失。
用VESTA打开后，优化前构型为：
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用VESTA打开文件后Output中显示：Number of polygons and unique vertices on isosurface = 0 (0)
138 atoms, 16 bonds, 0 polyhedra; CPU time = 6 ms ， 记事本打开后显示一共有111个原子。
优化后构型为：
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用VESTA打开文件后Output中显示：Number of polygons and unique vertices on isosurface = 0 (0)
111 atoms, 19 bonds, 0 polyhedra; CPU time = 5 ms，记事本打开后原子数也是111个。