标题: MS软件做pvdf膜吸附葡聚糖，动力学过程中遇到的能量过大的问题 [打印本页] 作者Author: 柳紫凝 时间: 2024-4-15 13:43 标题: MS软件做pvdf膜吸附葡聚糖，动力学过程中遇到的能量过大的问题 用的是forcite模块，想做的是pvdf膜和葡聚糖和腐殖酸的吸附过程，然后计算一下结合能。按照查找到的文献的参数去进行动力学，compass力场，nvt系综，先进行300ps，再进行1ns过程，腐殖酸没有问题，能得出的和实验相对应的结果。由于实验中用的是40000分子量的葡聚糖，然后进行动力学的时候，有了报错。
Nose mass parameter, Q mass: 128.27 kcal/mol*ps^2
Dynamics calculation - Aborting dynamics.
An unphysical integration step (>100 Angstroms) has been detected.
Try relaxing the structure with geometry optimization, reducing the time step,
reducing the temperature or a combination of these.