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标题: sobeda分析结果与IGMH不符 [打印本页]

作者
Author: manying 时间: 2024-4-15 19:12
标题: sobeda分析结果与IGMH不符
老师，这是我做的IGMH散点图以及等值面图，图中是以绿色范德华相互作用为主。但自己使用sobeda进行过能量分解分析得到结果是以轨道相互作用为主导作用。不知这样该如何解释。轨道相互作用与范德华相互作用是否存在交集

作者
Author: Satoru 时间: 2024-4-15 21:29
我猜，IGMH是弱相互作用在空间中的“分布”。色散吸引可以分布在比较大的区域里，但是整体的强度（作用能）不是很大，而轨道作用强度大但是在空间里比较集中，对应IGMH的点比较少。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-16 00:35
怎么连sobEDA的结果也不给

作者
Author: manying 时间: 2024-4-16 09:06

sobereva 发表于 2024-4-16 00:35
怎么连sobEDA的结果也不给

不好意思，老师。这个是sobeda结果
Total interaction energy:    -6.74 kcal/mol

Physical components of interaction energy derived by sobEDA:
Electrostatic (E_els):    -5.63 kcal/mol
Exchange (E_x):    -6.02 kcal/mol
Pauli repulsion (E_rep):    25.12 kcal/mol
Exchange-repulsion (E_xrep = E_x + E_rep):    19.10 kcal/mol
Orbital (E_orb): -11.34 kcal/mol
DFT correlation (E_DFTc):    -5.13 kcal/mol
Dispersion correction (E_dc):    -3.74 kcal/mol
Coulomb correlation (E_c = E_DFTc + E_dc):    -8.88 kcal/mol

Variant of sobEDA for weak interaction (sobEDAw):
Note: 62.83% DFT correlation is combined with dispersion correction to yield a SAPT-like dispersion term
Electrostatic (E_els):    -5.63 kcal/mol
Exchange-repulsion (including scaled DFT correlation):    17.19 kcal/mol
Orbital (E_orb): -11.34 kcal/mol
Dispersion (E_disp):    -6.97 kcal/mol

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-17 04:01
当前等值面没有那么绿，明显有一定程度的蓝色（被左边氧原子挡住了不少），如果是普通范德华作用，蓝不到这种程度
当前能量分解说明轨道相互作用不可忽视，如果感兴趣可以按照化学键方式考察，比如用Multiwfn算Mayer键级、NAdO（http://sobereva.com/535）、ETS-NOCV（http://sobereva.com/609）等

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