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标题: 求助V6O7(OR)12、NBu4PF6、乙腈盒子中的相互作用能的分析与计算 [打印本页]

作者
Author: 果果123 时间: 2024-4-16 19:59
标题: 求助V6O7(OR)12、NBu4PF6、乙腈盒子中的相互作用能的分析与计算
本帖最后由果果123 于 2024-4-17 09:47 编辑

使用Gromacs模拟了60*60*60盒子中放置了 1分子 V6O7(OR)12 (R=CH3 C2H5 C3H7) 、100 分子 NBu4PF6、1650 分子的乙腈。经过径向分布函数的分析，发现在溶液中V6O7(OR)12与(NBu4)+离子之间还有溶剂分子的存在，想分析其间溶剂分子与溶液中分子自由交换的难易程度。
故想分析附着在分子表面的(NBu4)+离子与其间溶剂分子的相互作用以及附着在分子表面的 (NBu4)+离子与V6O7(OR)12 相互作用的相对强弱。分析时是否只能通过相互作用能的相对大小来分析相互作用的相对强弱？可以通过什么方法计算相互作用能？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-17 05:13
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “相互作用能的分析与计算” 改了，以后务必注意！

恰当用标点符号！

作者
Author: Kiteliberator 时间: 2024-10-10 10:32
请问您乙腈分子的gro文件和itp文件是从哪里下载的

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