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标题: 求助：GROMACS中可以分别计算每个分组的势能吗 [打印本页]

作者
Author: wu1ongcha 时间: 2024-4-17 11:12
标题: 求助：GROMACS中可以分别计算每个分组的势能吗
各位老师好，请问GROMACS中可以分别计算每个分组的势能吗？使用定义能量组的方法做了尝试，但是gmx energy中仍然只有体系总势能，没有分组势能。十分感谢。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-18 08:54
重新产生tpr，把这个组排除掉，并且把轨迹中这个部分也排除掉，再rerun，得到的势能和原来的差值就是这个组的势能

作者
Author: wu1ongcha 时间: 2024-4-18 10:13

sobereva 发表于 2024-4-18 08:54
重新产生tpr，把这个组排除掉，并且把轨迹中这个部分也排除掉，再rerun，得到的势能和原来的差值就是这个组 ...

感谢sob老师的解答

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