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标题: 求助在生物体内发生的二萜合成反应能垒有60kcal/mol是否合理 [打印本页]

作者
Author: 起个名字特难丶 时间: 2024-4-18 10:01
标题: 求助在生物体内发生的二萜合成反应能垒有60kcal/mol是否合理
本帖最后由起个名字特难丶于 2024-4-18 10:03 编辑

二萜的5555环转变为5654环，能垒有60kcal/mol，过渡态唯一虚频为-1277.75
IRC结果如下：
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这是其他文献里对二萜合成的计算，能垒一般不超过15kcal/mol
DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-Carbocation-Free Reaction Cascades | JACS Au
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求助各位老师有没有寻找环转变的经验和方法，谢谢各位老师！

作者
Author: dnlx 时间: 2024-4-18 10:20
完全不合理，60 kcal/mol的能垒在100摄氏度至少需要几千万年才能看到反应。

这种生物反应很可能是酸碱催化的，文献模拟的也是碳正离子的反应。你模拟的好像是中性氢原子在单键上的1，2转移，这个能垒当然极高。

作者
Author: 起个名字特难丶 时间: 2024-4-18 16:51

dnlx 发表于 2024-4-18 10:20
完全不合理，60 kcal/mol的能垒在100摄氏度至少需要几千万年才能看到反应。

这种生物反应很可能是酸碱催 ...

明白了，谢谢老师，我的电荷和自选多重度为1 1，但是能垒确实很高，我再去寻找其他可能的路径。

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