计算化学公社

标题: gromacs提示PME实空间截断半径和the optimal load limit的note的问题 [打印本页]

作者
Author: ydq 时间: 2024-4-22 22:27
标题: gromacs提示PME实空间截断半径和the optimal load limit的note的问题
各位老师，PME实空间截断半径和第二个note里面的the optimal load limit这两个设置是mdp里面什么关键词？好迷……

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-23 08:21
rcoulomb
fourierspacing

作者
Author: ydq 时间: 2024-4-23 21:30

sobereva 发表于 2024-4-23 08:21
rcoulomb
fourierspacing

sob老师，想问下像这两条note，如果选择忽略对模拟结果的准确性影响大吗（我的体系是纤维素+水+盐，模拟纤维的溶解状况）。还是说有note即使有时候仍可以跑完md，但最好还是能改掉就都改掉

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-24 06:31

ydq 发表于 2024-4-23 21:30
sob老师，想问下像这两条note，如果选择忽略对模拟结果的准确性影响大吗（我的体系是纤维素+水+盐，模拟 ...

只影响效率，不影响合理性
如果不那么在乎计算耗时就不用管

作者
Author: ydq 时间: 2024-4-24 10:58

sobereva 发表于 2024-4-24 06:31
只影响效率，不影响合理性
如果不那么在乎计算耗时就不用管

感谢老师！

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