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标题: 限制性优化opt=cartesian有两个疑惑请教 [打印本页]

作者
Author: 疯狂学习 时间: 2024-4-23 15:43
标题: 限制性优化opt=cartesian有两个疑惑请教
各位大佬，限制性优化大分子寻找过渡态时用了opt=cartesian，这里有两个疑惑请教：
1.irc需要加cartesian吗，因为加了irc=cartesian就不是正常意义的irc，但因为又是限制性优化大分子，因此产生了疑惑；
2.跑完irc后优化两端产物时，需要加opt=cartesian吗，因为加了cartesian相对于未加难收敛。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-4-23 16:00
opt=cartesian只是改变收敛行为，并不会影响结果，所以是否加opt=cartesian不需要统一
IRC不需要且不能加cartesian（除非有另外的原因）。不能因为opt=cartesian和irc=cartesian都叫cartesian，就认为两者是需要统一的，实际上两者不仅不需要统一，而且意义根本不相关。
opt=cartesian代表用笛卡尔坐标而非内坐标做结构优化，但不管用什么坐标，极小值点结构都是一致的，只不过收敛到极小值点的难度不一样。可以类比成在(0,+∞)上寻找y=f(x)和y=f(x^2)的极小值点，两者的结果是等价的，但因为函数形状不一样，找到极小值点的难度可能有区别。
irc=cartesian代表用笛卡尔坐标而非质量权重笛卡尔坐标做IRC，因为IRC不仅涉及平衡结构，所以改变坐标系会对IRC路径有影响。例如一个反应如果同时涉及氢原子的运动和一个重原子的运动，而且两者感受到的梯度差不多大，那么在默认的质量权重笛卡尔坐标下，氢原子一开始的移动幅度更大，氢原子走出很远以后重原子才有明显移动；在笛卡尔坐标下，氢原子和重原子的移动幅度差不多大

作者
Author: 疯狂学习 时间: 2024-4-23 16:02

wzkchem5 发表于 2024-4-23 16:00
opt=cartesian只是改变收敛行为，并不会影响结果，所以是否加opt=cartesian不需要统一
IRC不需要且不能加c ...

谢谢大佬，明白了

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