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标题: MSST模拟需要把单斜晶体变为正交晶体嘛 [打印本页]

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Author: wjybit 时间: 2024-4-24 10:33
标题: MSST模拟需要把单斜晶体变为正交晶体嘛
本帖最后由 wjybit 于 2024-4-24 11:44 编辑

请问各位大佬，使用CP2K做多尺度冲击MSST，打算对附件的结构沿（010）晶向做冲击，需要把单斜晶体变为正交晶体嘛，如果需要，一般采用哪些软件进行变换啊

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Author: sobereva 时间: 2024-4-25 06:20
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并不需要非得b=Y、c=Z

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Author: yaochuang 时间: 2024-5-17 19:59

sobereva 发表于 2024-4-25 06:20
并不需要非得b=Y、c=Z

sob老师您好，意思就是不一等非得是正交晶体，通过旋转晶胞的方向可以使b，c轴与X方向垂直吗？哪怎么把一个三斜晶体的b和c轴调整到和X方向正交呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-18 03:09

yaochuang 发表于 2024-5-17 19:59
sob老师您好，意思就是不一等非得是正交晶体，通过旋转晶胞的方向可以使b，c轴与X方向垂直吗？哪怎么把一 ...

是
三斜不行，需要先变换成正交的，自己重新定义晶格，或者用atomsk程序自动搞（之前论坛我回复过，首页google框搜）

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Author: yaochuang 时间: 2024-5-18 07:10

sobereva 发表于 2024-5-18 03:09
是
三斜不行，需要先变换成正交的，自己重新定义晶格，或者用atomsk程序自动搞（之前论坛我回复过，首页 ...

谢谢sob老师，我用atomsk转化了，但是转化后晶体变的非常大，包含几万个原子，没法继续下一步计算，请问这种情况应该怎么处理呢？

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Author: sobereva 时间: 2024-5-18 23:47
参考此文MSST计算HMX和其它分子界面体系的模型
Molecules 2022, 27, 2787

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Author: yaochuang 时间: 2024-5-19 15:34

sobereva 发表于 2024-5-18 23:47
参考此文MSST计算HMX和其它分子界面体系的模型
Molecules 2022, 27, 2787

谢谢sob老师，我先学习一下。

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