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标题: Sobtop原子类型识别问题 [打印本页]

作者
Author: 大村驴 时间: 2024-4-27 01:51
标题: Sobtop原子类型识别问题
我的Cu配合物结构中，似乎Cu会被识别为sp3 C。问题出在1生成拓扑、4指认AMBER原子类型位置。（之前还出现过Fe被识别为F）
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所用mol2文件见附件。所用sobtop版本为1.0(dev3.2)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-4-27 08:19
本身GAFF力场就没有描述Cu的原子类型，用选项6自己手动修改原子类型就完了

作者
Author: 大村驴 时间: 2024-4-27 14:42

sobereva 发表于 2024-4-27 08:19
本身GAFF力场就没有描述Cu的原子类型，用选项6自己手动修改原子类型就完了

明白了，谢谢老师

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