计算化学公社

标题: 审稿意见：能量数值位数保留问题 [打印本页]

作者
Author: Dolantin 时间: 2024-5-1 08:49
标题: 审稿意见：能量数值位数保留问题
本帖最后由 Dolantin 于 2024-5-1 08:49 编辑

我用得是高斯+shermo软件计算水溶液中有机小分子体系，是根据该帖子【谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算http://sobereva.com/327】得出的能量。
审稿人提到，在SI中"Finally, no method is that precise that allows for an accuracy of 0.01 or 0.1 kJ/mol. Please round your energy values to the next full kJ/mol. Everything else provides a wrong impression of accuracy." 下面表格Gsoln列是溶质在溶剂环境下标况时的自由能（绝对数值），正文中能垒图标注数值我是以kJ/mol为单位保留两位小数，取能量相对数值。 “next full kJ/mol.”是取整数的意思吗？我看了些其他计算化学的paper，以kJ/mol为单位时，有取整数的，也有保留一位、两位小数的，不太理解审稿人意思。请教下大家啦
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作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-1 09:56
以kJ/mol和kcal/mol为单位时热力学数据通常保留一位小数，例如下文

谈谈如何计算环张力能：以CPP和碳单环体系为例
http://sobereva.com/698（http://bbs.keinsci.com/thread-42968-1-1.html）
理论设计由18碳环与锂原子构成的电场可控的光学开关
http://sobereva.com/630（http://bbs.keinsci.com/thread-27232-1-1.html）

对于较高精度的理论方法，在误差抵消充分时，可以精确到1 kJ/mol的数量级甚至更低，保留一位小数是得当的。

作者
Author: Dolantin 时间: 2024-5-1 10:16

sobereva 发表于 2024-5-1 09:56
以kJ/mol和kcal/mol为单位时热力学数据通常保留一位小数，例如下文

谈谈如何计算环张力能：以CPP和碳单 ...

谢谢sob老师回复，这是我的计算级别：opt freq：B2PLYP-D3(BJ)/def2-TZVP，单点：B2PLYP-D3(BJ)/ma-QZVPP。以kJ/mol为单位，我是不是可以选择保留一位小数？另外以Hartree的单位的那几列，取三位小数是否妥当呢？担心没按审稿人的要求来，印象不好，因为提了挺多负面意见的

作者
Author: GoldenBaby 时间: 2024-5-1 11:09

Dolantin 发表于 2024-5-1 10:16
谢谢sob老师回复，这是我的计算级别：opt freq：B2PLYP-D3(BJ)/def2-TZVP，单点：B2PLYP-D3(BJ)/ma-QZVPP ...

你确定B2PLYP你能用来做振动分析？

作者
Author: Dolantin 时间: 2024-5-1 11:22

GoldenBaby 发表于 2024-5-1 11:09
你确定B2PLYP你能用来做振动分析？

一开始选的opt freq计算水平确实有点高了，不过体系小，算得挺快的。审稿人没提我就不改了，不然得全部重算

作者
Author: beefly 时间: 2024-5-1 12:44
本帖最后由 beefly 于 2024-5-1 12:46 编辑

为什么Electronic energy写全称，自由能G用简写的符号？
为什么Hartree不加括号，kJ/mol加括号？
为什么Gsoln要用kJ/mol单位？怎么不换算成津巴布韦币呢？

就冲这些细节，勉强给个大修，如果是一区二区刊物可以拒稿。

作者
Author: Dolantin 时间: 2024-5-1 19:21

beefly 发表于 2024-5-1 12:44
为什么Electronic energy写全称，自由能G用简写的符号？
为什么Hartree不加括号，kJ/mol加括号？
为什么G ...

谢谢老师指正，这就改

。第一篇文章，确实写得水平差些

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-1 22:34

Dolantin 发表于 2024-5-1 10:16
谢谢sob老师回复，这是我的计算级别：opt freq：B2PLYP-D3(BJ)/def2-TZVP，单点：B2PLYP-D3(BJ)/ma-QZVPP ...

可以一位
给出绝对能量毫无意义，属于自找挨批的行为。Chemistry is about change

作者
Author: Dolantin 时间: 2024-5-2 14:39

sobereva 发表于 2024-5-1 22:34
可以一位
给出绝对能量毫无意义，属于自找挨批的行为。Chemistry is about change

好的，明白了

作者
Author: ra2123456 时间: 2024-10-24 19:33

beefly 发表于 2024-5-1 12:44
为什么Electronic energy写全称，自由能G用简写的符号？
为什么Hartree不加括号，kJ/mol加括号？
为什么G ...

您好，请问您拒稿的时候会指明这些问题还是直接用客套话拒掉

作者
Author: beefly 时间: 2024-10-25 12:04

ra2123456 发表于 2024-10-24 19:33
您好，请问您拒稿的时候会指明这些问题还是直接用客套话拒掉

如果除了表格以外的正文内容还看得过去，我就只讲表格的具体问题。否则就说文章写作质量差，数据没有经过仔细整理

作者
Author: ra2123456 时间: 2024-10-25 15:32

beefly 发表于 2024-10-25 12:04
如果除了表格以外的正文内容还看得过去，我就只讲表格的具体问题。否则就说文章写作质量差，数据没有经过 ...

好的，谢谢您，遇到您这种直言不讳的审稿人也算是作者之幸，否则作者一直被拒可能都不知道自己错在哪

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