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标题: 求助:用GROMACS进行纤维素、水合物和气水混合物在一起模拟时,力场分配怎么设置 [打印本页]

作者
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1758924310    时间: 2024-5-2 19:36
标题: 求助:用GROMACS进行纤维素、水合物和气水混合物在一起模拟时,力场分配怎么设置
如题,在使用GROMACS进行水合物模拟时,多孔介质使用纤维素,想使用Amber14力场,单独调用力场可以运行,但纤维素、水合物和气水混合物在一起时,不清楚如何进行力场分配生成拓扑文件。还是说可以分别生成拓扑文件然后在将拓扑文件合在一起,请各位大佬们麻烦解答一下

作者
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sobereva    时间: 2024-5-2 23:15
没有叫Amber14的力场,只有Amber14SB
分别产生拓扑文件,根据拓扑文件的基本常识,自己写top并include它们
作者
Author:
1758924310    时间: 2024-5-2 23:26
sobereva 发表于 2024-5-2 23:15
没有叫Amber14的力场,只有Amber14SB
分别产生拓扑文件,根据拓扑文件的基本常识,自己写top并include它们

好的,谢谢sob老师




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