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标题: GROMACS win10 2019.6 gpu版计算速度问题 [打印本页]

作者
Author: xptracy 时间: 2024-5-2 22:02
标题: GROMACS win10 2019.6 gpu版计算速度问题
配置7950x+4090 win10 gpu版

在用win10 2019.6 gpu版跑9万原子，命令是gmx mdrun -v -deffnm md -pin on -pinstride 1 -nt 32 -notunepme 100ns要44h，任务管理器里CPU 显卡使用率100%

速度是不是很慢，还可以提升？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-2 23:11
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “计算速度问题” 改了，以后务必注意

作者
Author: xptracy 时间: 2024-5-6 11:20
好的谢谢

作者
Author: lmch 时间: 2024-5-6 12:42
不应该啊，任务管理器默认的GPU通常不会100%，cuda子选项能有90%就不错了,加上-bonded gpu ，去掉-notunepme，

不对，7950x 16个物理核心，你用32线程，自然效率打折，

gmx mdrun -v -deffnm md -pin on -nt 16 -bonded gpu

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