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标题: linux系统安装gromacs时到make install一步时报错 [打印本页]

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Author: 2877321934 时间: 2024-5-3 13:44
标题: linux系统安装gromacs时到make install一步时报错
本人为linux小白，ubuntu系统是最近才安装的新系统，正按照sob老师的博文http://sobereva.com/457安装gromacs，先前的步骤都严格执行的情况下，在 (, 下载次数 Times of downloads: 23)
红框圈出来的一步（make install -j）中发生错误，错误结果如下图 (, 下载次数 Times of downloads: 19) ，尝试将-j去了也一样，前面步骤除了将/sob改为我自己的目录名/root外都严格执行，像求助一下如何解决

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Author: sobereva 时间: 2024-5-3 20:07
说明gromacs版本、操作系统版本。操作系统自带的gcc太老会导致不兼容
Ubuntu的情况我不清楚，我也反感Ubuntu，CentOS 7、8编译2018.8不会有问题

作者
Author: 2877321934 时间: 2024-5-3 21:30

sobereva 发表于 2024-5-3 20:07
说明gromacs版本、操作系统版本。操作系统自带的gcc太老会导致不兼容
Ubuntu的情况我不清楚，我也反感Ubun ...

系统版本为ubuntu22，gromacs版本为2018.8

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-3 23:52

2877321934 发表于 2024-5-3 21:30
系统版本为ubuntu22，gromacs版本为2018.8

尝试编译gmx更新的版本

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Author: 喵星大佬 时间: 2024-5-4 02:32
ubuntu22的自带gcc11编不过gmx2018，而且为啥要用那么古老的版本。。。。要稳定版推荐2021.7，gcc11可以编出来，一定要用18的话ubuntu退回20用gcc9可以

作者
Author: 2877321934 时间: 2024-5-4 11:58

sobereva 发表于 2024-5-3 23:52
尝试编译gmx更新的版本

@喵星大佬感谢两位老师我去试试

作者
Author: 2877321934 时间: 2024-5-4 12:51

sobereva 发表于 2024-5-3 23:52
尝试编译gmx更新的版本

@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的gromacs

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-4 17:07

2877321934 发表于 2024-5-4 12:51
@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的grom ...

2023目前的最新版

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Author: 喵星大佬 时间: 2024-5-4 17:13

2877321934 发表于 2024-5-4 12:51
@喵星大佬还有追问一下两位老师，哪个版本的gromacsGPU加速性能最好，想装个计算速度比较快的版本的grom ...

对于NV的GPU，2021以后在相同设置下几乎没有区别，22版本之后引入的一堆bug不知道修的咋样了，所以如果不用新功能就21.7，对于非NV的GPU，必须2023以后的版本，目前可以用2023.5或2024.1

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Author: 2877321934 时间: 2024-5-4 19:22

sobereva 发表于 2024-5-4 17:07
2023目前的最新版

@喵星大佬感谢两位老师

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