计算化学公社

标题: 单斜盒子NPT模拟出现温度异常突变 [打印本页]

作者
Author: wjybit 时间: 2024-5-3 13:59
标题: 单斜盒子NPT模拟出现温度异常突变
大佬们，我最近最NPT模拟单斜晶胞的NPT分子动力学模拟，第二步温度直接飙升到了4000K，是因为必须使用正交盒子吗，还是我的inp文件有问题啊，感谢大佬解答，之前用相同的设置跑正交盒子就没有遇到问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-3 20:13
跟单斜没必然关系
这么小晶胞做MD根本没意义，会等效施加严重的虚假的周期性约束

作者
Author: wjybit 时间: 2024-5-4 16:57

sobereva 发表于 2024-5-3 20:13
跟单斜没必然关系
这么小晶胞做MD根本没意义，会等效施加严重的虚假的周期性约束

sob老师，我这个已经扩胞3x3x3了啊，500多个原子了，还是小吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-4 17:32

wjybit 发表于 2024-5-4 16:57
sob老师，我这个已经扩胞3x3x3了啊，500多个原子了，还是小吗

我没注意到MULTIPLE_UNIT_CELL 3 3 3，当前可以

尝试先用NVT跑，或者改用DFT跑。

作者
Author: wjybit 时间: 2024-5-4 18:01

sobereva 发表于 2024-5-4 17:32
我没注意到MULTIPLE_UNIT_CELL 3 3 3，当前可以

尝试先用NVT跑，或者改用DFT跑。

好的sob老师

作者
Author: wjybit 时间: 2024-5-4 20:05
本帖最后由 wjybit 于 2024-5-4 20:25 编辑

sobereva 发表于 2024-5-4 17:32
我没注意到MULTIPLE_UNIT_CELL 3 3 3，当前可以

尝试先用NVT跑，或者改用DFT跑。

sob老师，我如果把使用multiwfn对这个单斜晶胞进行晶胞变换，就是a和b之间的变换，就会导致NPT模拟的温度突变，是multiwfn无法对单斜晶胞坐标轴交换吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-5 23:43

wjybit 发表于 2024-5-4 20:05
sob老师，我如果把使用multiwfn对这个单斜晶胞进行晶胞变换，就是a和b之间的变换，就会导致NPT模拟的温度 ...

那个功能目前仅限正交晶胞。
变换完了是否合理，直接在Multiwfn图形窗口里一看便知。如果还搞不清楚，基于当前晶胞进行扩胞，看晶胞接壤处是否合理便知。

作者
Author: 1285050231 时间: 2024-9-19 14:55

wjybit 发表于 2024-5-4 18:01
好的sob老师

同学，你这个最后搞定了吗？我也是NPT出现了和你类似的情况，第二步开始就飙升到6000-7000K。换了poisson solver也是一样的问题，没法搞定。还是说这种情况只能跑NVT了？

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)