计算化学公社

标题: KiSThelP软件做Eckart校正,生成反应路径.kinp文件报错 [打印本页]

作者
Author:
Dolantin    时间: 2024-5-4 12:22
标题: KiSThelP软件做Eckart校正,生成反应路径.kinp文件报错
本帖最后由 Dolantin 于 2024-5-4 15:01 编辑

由于审稿人质疑 TST/Wigner方法计算的速率常数结果,又不想使用审稿人提到的Tunnex、Polyrate软件,所以打算用KiSThelP软件做Eckart校正,按照此帖http://sobereva.com/246做Eckart校正时,生成反应路径出现如下报错。对IRC做振动分析的输入文件和 反应路径文件生成目录也贴出来了。
求教下大家如何解决报错,或者有没有更好的回复审稿人的方式,谢谢各位!

审稿人质疑:
Finally, the authors are probably aware that the “simple” tunneling corrections are not very accurate. Please provide additional information on how much the barrier is altered by the tunneling correction. If this is a substantial contribution, it can be expected that the crude corrections are not really correctly describing the real system and more elaborate corrections like Schreiner’s Tunnex or Truhlar’s Polyrate are required.                     As mentioned above, I am extremely skeptical about the results of the simple Wigner correction.
(, 下载次数 Times of downloads: 16) (, 下载次数 Times of downloads: 18)
(, 下载次数 Times of downloads: 18)









作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-4 16:15
什么操作细节都没有,别人帮不了你
先把我博文里的例子体系成功用Eckart方式得到结果再说
作者
Author:
Dolantin    时间: 2024-5-4 16:18
sobereva 发表于 2024-5-4 16:15
什么操作细节都没有,别人帮不了你
先把我博文里的例子体系成功用Eckart方式得到结果再说

好的好的,这就按sob老师说的操练一番
作者
Author:
Dolantin    时间: 2024-5-7 15:58
本帖最后由 Dolantin 于 2024-5-7 15:59 编辑
sobereva 发表于 2024-5-4 16:15
什么操作细节都没有,别人帮不了你
先把我博文里的例子体系成功用Eckart方式得到结果再说

sob老师,IRC步长stepsize我设置为1,IRC上自由能最大点和电子能量最大点也是重合的,最终得到的k-T曲线重合,我查看重合曲线的数据也是一样的,这样正常吗?是不是就说明变分效应对这个反应不明显呢?
(, 下载次数 Times of downloads: 18)
C:\Users\Administrator\Desktop\天若OCR截图目录

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-8 20:28
Dolantin 发表于 2024-5-7 15:58
sob老师,IRC步长stepsize我设置为1,IRC上自由能最大点和电子能量最大点也是重合的,最终得到的k-T曲线 ...

如果你确信计算方式无误的话,说明变分效应至少在你当前算各个点自由能的温度下可以忽略
作者
Author:
Dolantin    时间: 2024-5-9 07:55
sobereva 发表于 2024-5-8 20:28
如果你确信计算方式无误的话,说明变分效应至少在你当前算各个点自由能的温度下可以忽略

好嘞,谢谢sob老师!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3